继承了前身车型（CBR650F）的脚踏位置，方向把连接在方向柱的下方，方向把的下沉设计让压弯等需要频繁加减速的时刻更显人车合一的乐趣。此外，前后分体式座椅的形状设计考虑了骑行时的脚步舒适。

辅助滑动离合器能够减轻骑手的驾驶疲劳，让人更为安心。通过辅助机能可以降低操作负重，并且也能减少降档时候引擎制动导致的后轮令人不适的冲击顿挫，除了使用上更为轻快以外，驾驶感受也更为顺滑舒适。

CBR650R采用了Honda Selectable Torque Control(Honda可调节牵引力控制系统)。系统根据前后轮速差值调节燃料喷射量，从而优化发动机扭矩，通过控制后轮驱动力，减轻后轮打滑。可选择左手把的开关操作开启或关闭。

前刹采用φ310mm浮动碟刹盘和辐射式对向卡钳。后刹采用φ240mm单碟刹盘和单缸卡钳。可以回馈骑手线性的减速感受，确保充分的制动力，在各种各样的骑行场景下都能够提供满满安定感的刹车控制性能。

全新CBR650R在前避震方面使用了Showa SFF-BP，有助于获得轻盈、优质的操控感受。后悬架与摆臂之间的紧固部分采用滑枕式滚珠轴承联接，进一步提高了缓冲性能和抓地力。钢刃的悬架系统不仅在赛道上性能的表现分外优异，在公路全速段其也能拥有稳健的表现。

仪表显示器表面覆盖一层透明绿色亚克力材料，全液晶显示。根据档位、水温、转速的峰值，结合引擎转速，仪表上会提示换挡时机。文字字体比上一代更大，背光灯的角度重新设定，通过各种修正提高了仪表的辨识度。

前脸搭载了延续CBR系列血统的双LED头灯，在追求独自风格的道路上，导入了CBR650R特有的双通道设计吸气系统，两个进气口位于头灯下方两侧。此外，头灯左右处中段整流罩至上段结合处耳朵般的开口设计，使得车体前部投影面积最小化，从而降低风阻，骑行时能得到更为轻快的操控。

为了实现车体的轻量化，整流罩的设计采用了最小化理念，中段整流罩自上而下与消音器部分浑然一体，展现出一触即发的轮廓感，结合前倾的骑行姿势，让人车合一感得到了进一步提升。